计算机的最根本的语言，还是0、1、0、1、0、1、0、1、吧？

数学化与数字化，二者有所不同。五行生克制化逻辑完全可以用数学来表达，进而用计算机来实现。这方面西北大学哲理数学研究所孟凯韬已经做出研究，可在网上搜索《阴阳五行数学及其在中医学上的应用》一书。

很高兴有中医来讨论这问题，我可是一点中医基础都没有的，不要将我的军。
计算机的最底部的语言是0，1组成，通过这些0，1可以组织成各种高级运算和逻辑运算。这归功于近些年发展起来的各种软件，使我们可以脱离枯燥无味的0，1来编程，可以用高级语言（类似于人类语言）来编程。
简单举个例子吧：比如我们要得到A的结果，而A是许多因素共同影响它的，设它们为x,y,z,t，我们现定义每个变量和A的关系是什么，对应关系有多大，来赋予x,y,z,t各自的属性，比如，x为正（阳），那么A为负（阴）；y量值为100，A就增加30等等，这里还可有时间变量t，t时间增加多少，A就要减去百分几，都设好以后，成为一个新软件。使用时，我们根据病情输入x,y,z,t，由计算机代替人脑来做出诊断结果A。当然实际会复杂很多，所以不是一两个人能够做到的。
目前还没发现人们想得出来的问题电脑不能做。

数字化过程都要先做成数学公式（数学化），才能用于计算机。

只要有确定关系，就可用计算机。只要人能说清楚，计算机就能算清楚。只要人是糊涂蛋，计算机就是糊涂蛋。

这样做的好处就是可以集所有最优秀的中医经验，并可不断完善，成为一套完整的系统。

当然，如果有了这套系统，可能有些行医者饭碗就没了。

我跟楼主一样非中医人士，自学中医，想建立中医专家系统。数学建模是无可避免，然而最大的问题就是对于中医基础理论根本没有完备统一的正确认识，这也是中医界现在自身的问题。诚如5楼所言，要是对中医理论糊涂，建出来的中医系统就是糊涂蛋。

中医的进展不是发达,而是自的的保护.

楼上的问题很好，确实能精通中医又懂电脑的人才太少了。可能编程的人是中医的糊涂蛋。
这要靠学校的培养，学中医的要把电脑课程作为必修课。